X档案：我要相信

自2002年《X档案》系列后六年，前联邦探员丹娜·斯科莉调任教会医院担任医师，福克斯·穆德则过着隐居生活，持续关注超自然现象。某天FBI探员前来求助，称维吉尼亚州接连有数名女子神秘失踪，包括一名联邦探员，因神父约瑟夫声称看到犯罪画面，希望有超自然案件调查经验的二人协助，随着调查深入，黑暗远超想象，搭档面临巨大考验。